Logo
Unioonpeedia
Side
Hankige see Google Play
Uus! Lae Unioonpeedia oma Android ™!
Installi
Kiiremini kui brauser!
 

SNPde annotatsioon

Index SNPde annotatsioon

Üksiknukleotiidsete polümorfismide (SNP) annoteerimine on individuaalsete SNP-de efekti või mõju ennustamine kasutades SNP-de annoteerimise töövahendeid.

37 suhted: Annotatsioon, Üksiku nukleotiidi polümorfism, Bioinformaatika, Biomarker, Biosüsteem, Domeen (bioloogia), Ekson, Epigeneetika, Fülogenees, Fenotüüp, Geen, Geeniregulatsioon, Geneetiline assotsiatsiooniuuring, Genoom, Genoomika, Informatsiooni-RNA, Inhibitsioon, Inimene, Kromatiin, Liik (bioloogia), Lookus, Masinõppimine, Mikro-RNA, Mudelorganism, Nukleosoom, Nukleotiidid, Populatsioon, Populatsioonigeneetika, Promootor, Ribosoom, RNA, Splaissimine, Transkriptsioon (geneetika), Transkriptsioonifaktor, Translatsioon, Transpordi-RNA, Valgud.

Annotatsioon

Annotatsioon (ladina sõnast annotatio 'kirjalik märkus, ülestähendus'; ebasoovitatav termin abstrakt Autorite kollektiiv, 2014. Hariduse ja kasvatuse sõnaraamat. Eesti Keele Sihtasutus. Lk 44) on raamatu, artikli või muu kirjutise lühike tutvustus, mis mõnikord annab ka hinnangu.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Annotatsioon · Näe rohkem »

Üksiku nukleotiidi polümorfism

DNA molekul 1 erineb DNA molekulist 2 ühe aluspaari juures (C/T polümorfism) Üksiku nukleotiidi polümorfismid ehk üksiknukleotiidsed polümorfismid (inglise single nucleotide polymorphisms; SNPs (hääldatakse snips) eestipäraselt SNP-d) on DNA järjestuse variatsioonid, mis on toimunud ühe genoomi nukleotiidi (A, T, C või G) muutumisel.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Üksiku nukleotiidi polümorfism · Näe rohkem »

Bioinformaatika

Bioinformaatika on rakendusmatemaatika haru, mis tegeleb molekulaarbioloogia arvutuslike probleemidega.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Bioinformaatika · Näe rohkem »

Biomarker

Biomarker on elusorganismi teatud karakteristik (tüüpiliselt organismis leiduv molekul, nt valk või DNA lõik), mille hulk või kontsentratsioon näitab organismi füsioloogilist seisundit, sh võimaldab hinnata toksiliste ainete poolt esile kutsutud füsioloogilisi muutusi organismis.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Biomarker · Näe rohkem »

Biosüsteem

Biosüsteem ehk bioloogiline süsteem on iseuuenev isereguleeruv süsteem, mida saab vaadelda raku, organismi, koosluse, ökosüsteemi vm tasemel.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Biosüsteem · Näe rohkem »

Domeen (bioloogia)

Domeen (Regio) on bioloogias praeguse seisuga kõrgeim taksonoomiline kategooria, üks eluslooduse suurjaotusi.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Domeen (bioloogia) · Näe rohkem »

Ekson

Ekson (ingl exon, lühend terminist "ekspresseeruv regioon") on eukarüootse geeni DNA lõik, mis jääb selle geeni põhjal loodud pre-mRNA protsessimise järel küpse mRNA koosseisu.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Ekson · Näe rohkem »

Epigeneetika

Epigeneetika on teadus, mis uurib organismide geeniekspressioonist sõltuvaid pärilikke muutusi, mis ei ole seotud genoomi muutustega.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Epigeneetika · Näe rohkem »

Fülogenees

parafüleetiline rühm (sinine) Fülogenees ehk põlvnemiskäik on mingi organismide rühma evolutsiooniline päritolu.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Fülogenees · Näe rohkem »

Fenotüüp

Fenotüübi näitamine, kärbse silmavärvus sõltuvalt genotüübist. Legend: E (tähistab silma) ja ülaindeksid: b (musta), w (valget) Fenotüüp on indiviidi füsioloogiliste, morfoloogiliste keemiliste, käitumislike, arenguliste ja ehituslike tunnuste vaadeldav kogum.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Fenotüüp · Näe rohkem »

Geen

aluspaarist (punased põikipulgad). Tegelikult on geenid sadu kuni tuhandeid kordi pikemad. Geen (kreeka keeles genos tekkimine, sünd, saamine) on DNA või RNA nukleotiidjärjestus, mille põhjal sünteesitakse kindlat RNA-d. Geeni molekulaarne järjestus on bioloogiline informatsioon, mis osaleb nii ainu- kui ka hulkraksete organismide ja viiruste ülesehitamisel ning säilitamisel.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Geen · Näe rohkem »

Geeniregulatsioon

Geeniregulatsioon (inglise regulation of gene expression, gene regulation) on geenide ekspresseerumise ehk geeniekspressiooni mõjustamine läbi seda reguleerivate mehhanismide kompleksi.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Geeniregulatsioon · Näe rohkem »

Geneetiline assotsiatsiooniuuring

Geneetiline assotsiatsiooniuuring (ingl genome-wide association study, lühend GWAS, varem tuntud ka kui ülegenoomne assotsiatsiooniuuring) on uuringu tüüp geneetikas ja biostatistikas, kus otsitakse seoseid inimese geneetiliste muutujate ja fenotüübi vahel.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Geneetiline assotsiatsiooniuuring · Näe rohkem »

Genoom

Genoom on organismi kogu geneetiline informatsioon.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Genoom · Näe rohkem »

Genoomika

Genoomika on multidistsiplinaarne teadusharu, mis uurib genoome.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Genoomika · Näe rohkem »

Informatsiooni-RNA

Informatsiooni-RNA (inglise keeles messenger RNA, lühend mRNA) on RNA, mille molekulilt toimub translatsioon: informatsiooni-RNA nukleotiidijärjestuse põhjal sünteesitakse polüpeptiid.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Informatsiooni-RNA · Näe rohkem »

Inhibitsioon

Inhibitsioon ehk pärssimine ehk inhibeerimine on mingi protsessi vm aeglustamine, peatamine.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Inhibitsioon · Näe rohkem »

Inimene

Inimene ehk tarkinimene ehk nüüdisinimene (Homo sapiens 'tark inimene') on bioloogilise süstemaatika järgi loomaliik inimese perekonnast inimlaste sugukonnast esikloomaliste seltsist, kuuludes seega kõrgemate imetajate hulka.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Inimene · Näe rohkem »

Kromatiin

Kromatiini struktuur Kromatiin on DNA ja sellega seondunud valkude (histoonide) kompleks, millest moodustuvad eukarüootide ehk päristuumsete kromosoomid.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Kromatiin · Näe rohkem »

Liik (bioloogia)

Liik (ladina keeles species, lühend sp. või spec.) on taksonoomiline mõiste, mida bioloogias kasutatakse kindlal viisil omavahel sarnanevate organismide populatsiooni kohta.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Liik (bioloogia) · Näe rohkem »

Lookus

Lookus (ladina sõnast locus 'koht') on klassikalises geneetikas kromosoomi piirkond, kus paikneb mingi geen.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Lookus · Näe rohkem »

Masinõppimine

Masinõppimine (inglise keeles machine learning) on teadusvaldkond, mille eesmärk on välja töötada empiiriliste andmete põhjal otsuseid ja ennustusi tegevaid algoritme.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Masinõppimine · Näe rohkem »

Mikro-RNA

MikroRNA-203 sekundaarstruktuur MikroRNA-d (lühendatult miRNA; ingl microRNA) on lühikesed, keskmiselt 20–25 nukleotiidi pikkused üksikahelalised RNA-molekulid, mida sünteesitakse eukarüootsete rakkude tuumades.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Mikro-RNA · Näe rohkem »

Mudelorganism

Mudelorganism on organism, mida kasutatakse bioloogiliste protsesside uurimisel.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Mudelorganism · Näe rohkem »

Nukleosoom

Nukleosoom on valdavalt eukarüootides paiknev DNA ja valkude kompleks, mille abil on DNA pakitud kõrgemat järku struktuuri, et ta tuuma ära mahuks.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Nukleosoom · Näe rohkem »

Nukleotiidid

Nukleotiidid on orgaanilised molekulid, mis moodustavad suuri biopolümeere- nukleiinhappeid, näiteks DNA ja RNA.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Nukleotiidid · Näe rohkem »

Populatsioon

Ökosüsteemi tasemed: isend-'''populatsioon'''-kooslus-ökosüsteem-bioom-biosfäär Populatsioon ehk asurkond on kõik organismid, mis kuuluvad samasse liiki ja kasutavad elu-, sigimis-, ja toitumispaigana ühist geograafilist piirkonda ehk areaali.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Populatsioon · Näe rohkem »

Populatsioonigeneetika

Populatsioonigeneetika on geneetika haru, mis uurib geenide ja nende alleelide sageduste jaotust ja muutumist populatsioonides nelja põhilise evolutsioonimehhanismi tagajärjel: looduslik valik, geenitriiv, geenisiire ja mutatsioon.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Populatsioonigeneetika · Näe rohkem »

Promootor

Promootor on spetsiifiline DNA järjestus, millega seostub RNA polümeraas, alustades sealt transkriptsiooni.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Promootor · Näe rohkem »

Ribosoom

70S ribosoomi 50S alaühik. Kollane osa on rRNA ja sinine märgib valgulist osa. Punasega on märgitud aktiivsait Ribosoom translatsioonil. Näha on ka kahe alaühiku vahel olevad tRNA-d Ribosoom (inglise ribosome) on nii eel- kui ka päristuumse raku tsütoplasmas esinev kaheosaline molekulaarne masin, mis koosneb ribosomaalse RNA (rRNA) ja valgu molekulidest.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Ribosoom · Näe rohkem »

RNA

Ribonukleiinhape ehk RNA (inglise keeles ribonucleic acid; varasem eestikeelne lühend RNH) on bioloogiline makromolekul ehk biopolümeer.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja RNA · Näe rohkem »

Splaissimine

Splaissimine ehk splaissing (ka splaising; inglise keeles splicing) on protsess, mille käigus lõigatakse rakutuumas asuvast pre-mRNA molekulist välja intronjärjestused ning allesjäänud eksonitele vastavad osad ühendatakse.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Splaissimine · Näe rohkem »

Transkriptsioon (geneetika)

Transkriptsioon on matriitssüntees, mille käigus sünteesitakse DNA molekuli ühe ahela nukleotiidse järjestusega komplementaarne RNA molekul.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Transkriptsioon (geneetika) · Näe rohkem »

Transkriptsioonifaktor

TFIIB (transkriptsiooni faktor 2 beeta alaühik) kompleksis DNA molekuliga Transkriptsioonifaktoriks nimetatakse molekulaarbioloogias ja geneetikas valku, mis seondub spetsiifilistele DNA järjestustele, kontrollides seeläbi mRNA molekulide transkriptsiooni kiirust DNA-lt.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Transkriptsioonifaktor · Näe rohkem »

Translatsioon

tRNA-de (tumesiniste ühikute) lülitumist mRNA külge. Kummagi kahe kõrvutiasetseva tRNA teises otsas liituvad aminohapped. Aminohapete progresseeruval liitumisel tekib polüpeptiidahel, mis kasvab ribosoomi teisest otsast välja. Animatsiooni lõpus on näidatud ka seda, kuidas tekkiv polüpeptiidahel läbib valgulise kanali vahendusel rakusisest membraani. Translatsioon on rakkudes toimuv molekulaarne protsess, mille käigus ribosoomid sünteesivad mRNA põhjal aminohapetest koosneva polüpeptiidahela.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Translatsioon · Näe rohkem »

Transpordi-RNA

tRNA molekuli ruumiline struktuur Transport-RNA ehk tRNA on ribonukleiinhape, mis tegeleb rakus aminohapete transpordiga ribosoomi, kus geneetilise koodi alusel lisatakse aminohape sünteesitavasse valguahelasse.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Transpordi-RNA · Näe rohkem »

Valgud

aminohapet. Valgud ehk proteiinid on biopolümeerid, mille monomeerideks on aminohappejäägid.

Uus!!: SNPde annotatsioon ja Valgud · Näe rohkem »

VäljuvSaabuva
Hei! Oleme Facebookis nüüd! »